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来源:去秀 发布时间:2019年06月12日 17:44

几天前,Nature上登出了一篇生物学论文,内容主要是关于De novo蛋白质的结构。在文章的作者一栏,除了来自各个国家科研团队的科学家之外,还有一个引人注目的名字——“Foldit的玩家们”。

这篇论文的标题是“由公民科学家设计的De novo蛋白质”,论文的成果来自于一款十几年前被开发出来的多人在线澳门金沙网上娱乐官网“Foldit”。

“Foldit的玩家们”是这篇论文的第十五作者

Foldit是华盛顿大学计算机系和生物学系在2008年联合开发出的“实验性科学澳门金沙网上娱乐官网”,目的是借助大量玩家们的力量,找到可能存在的未知蛋白质结构——这是一项没什么捷径、但也并不困难的纯计算工作。

生物学家们已经通过大量实验解明了蛋白质结构的基本原理,只有符合这些原理的蛋白质才能正常存活,进而构成生物;但是蛋白质极为复杂,从基本原理倒推出所有可能存在的蛋白质结构需要大量的计算——预测蛋白质的结构是生物化学领域追求的最重要目标之一,在医学和生物学上都有着极其重要的意义。

蛋白质预测的流程图

Foldit从本质上来说是一款解谜类澳门金沙网上娱乐官网,玩家们在澳门金沙网上娱乐官网中要解开的谜题就是“所有正确的蛋白质结构组合”。澳门金沙网上娱乐官网教程会说明怎样的蛋白质才是正确的,而玩家们要发挥创意和想象力把蛋白质的各个部分拼起来,拼得越接近正确蛋白质,玩家获得的分数就越多。Foldit的玩法简单易懂,几乎不需要生物学知识,趣味性也不差——毕竟,Foldit可能是迄今为止开发阵容最豪华、谜题最多的解谜澳门金沙网上娱乐官网,它的开发者与其说是科学家们,不如说是自然规律本身。

Foldit的玩家们几乎永远不可能通关这款解谜澳门金沙网上娱乐官网,但这并没有妨碍到他们的热情。2010年,开发者公布说,有大约 57000 名玩家提供的结构组合要优于预测软件的模拟;一年后,一群玩家用了10天时间协助解读了一种病毒蛋白酶的晶体结构,这是艾滋病毒在细胞中复制、繁殖的关键——由于算力不足,这个问题已经悬置了15年。

十几年来,Foldit已经形成了自己的玩家社区。在澳门金沙网上娱乐官网的玩家论坛中,有新手入门,有心得分享,有Bug反馈。人们在这里讨论着“用系带将蛋白质限制在球体中”或者“解析黄曲霉素的另一种可能方法”这样的话题,就像其他澳门金沙网上娱乐官网的玩家在论坛里谈论副本攻略、澳门金沙网上娱乐官网技巧和配装心得一样。

如果把那些难懂的化学名词想象成其他澳门金沙网上娱乐官网中的黑话,这里就和一个普通的澳门金沙网上娱乐官网论坛没有任何区别。

Foldit论坛的帖子列表(机翻)

Foldit的意义不仅在于澳门金沙网上娱乐官网本身,它还启发了更多的生物学研究者,让他们也开始利用玩家群体辅助研究。其中最出名的类似研究,就是《星战前夜(EVE online)》的“探索计划”——玩家可以在EVE里玩一个内置小澳门金沙网上娱乐官网,鉴定、分类1300 万个人体细胞蛋白质染色图,获得澳门金沙网上娱乐官网内货币的奖励;上线仅两年,就有30万玩家参与其中,完成了3300万个图像分类,这些成果都被上传到了公开的人类蛋白图谱数据库之中,可供全世界的科学家使用。

EVE的内置小澳门金沙网上娱乐官网

“为了科学研究而澳门金沙网上娱乐官网”现在已经不是一个多么新潮的概念了。我们曾经介绍过多款用于帮助科研或公益目的的澳门金沙网上娱乐官网,有看上去还不错的,也有很多不怎么样的——它们大多是某些科学家一时兴起的尝试,很快就被放弃,也没法得出太多有价值的科学成果,Foldit则完全不同。

Foldit运营了十几年,还在不断更新——改进界面、简化操作、增加更多玩法,上一次更新就在几周之前。在Nature上搜索Foldit,能得出55篇文章,绝大部分都是引用Foldit成果的生物学论文。

在可预见的未来,Foldit还会给生物学家提供源源不断的研究数据。你可以在Foldit的官网金沙国际网上娱乐官网这款澳门金沙网上娱乐官网,澳门金沙网上娱乐官网支持Windows、OSX和Linux系统——也许有一天,你也可以声称“我玩澳门金沙网上娱乐官网玩成了Nature论文的作者”。

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